甘肅農業大學獸醫學科源自1946年成立的國立獸醫學院，1946年招收培養本科生，1953年招收培養碩士研究生，1984年招收培養博士研究生。2002年獲得一級學科授權，2003年獲批獸醫學博士后科研工作流動站，2000年和2007年分別獲得獸醫碩士和獸醫博士專業學位授權。2002年獸醫學一級學科獲得甘肅省重點學科，2017年獲得甘肅省特色學科。
本學科現有專任教師53人，其中教授17人（二級教授3人），研究員1人，副教授22人，高級實驗師（獸醫師）6人。博士研究生導師16人，碩士研究生導師43人。專任教師中有國家“百千萬人才工程”第一、二層次人選2人，國務院學位委員會學科評議組成員1人，教育部動物醫學專業教學指導委員會委員1人，國務院獸醫專業學位教學指導委員會副主任委員1人，國家級“突出貢獻專家”1人，全國“優秀教師”1人，甘肅省第一層次“領軍人才”3人，甘肅省“飛天學者”特聘教授2人，甘肅省“333”科技人才和“555”創新人才工程第一、二層次人選5人，甘肅省“高校跨世紀學科帶頭人”3人，國家教委“霍英東基金會獎勵”獲得者 3人，甘肅省“高校青年教師成才獎”獲得者6人，甘肅省“教學名師”2人，甘肅省“園丁獎”獲得者1人。有1個國家級“教學團隊”和1個甘肅省“教學團隊”。有“甘肅省牛羊胚胎工程技術研究中心”、“甘肅省動物醫學實驗教學示范中心”以及“獸醫學科研創新公用平臺”和動物醫院。萬元以上儀器設備240多臺（套），儀器設備總價值2300多萬元。
本學科下設基礎獸醫學、預防獸醫學、臨床獸醫學和動物醫學工程4個二級學科，形成了動物形態學、動物發病機理與病理學診斷、動物病原分子生物學與疫病防控、獸醫公共衛生與食品安全、動物生殖機能與調控、動物營養代謝病與中毒病、中藥作用機理與中西獸醫結合防治畜禽疾病、青藏高原特色動物遺傳改良與高效生態繁育等研究方向。培養全日制本科生4500余名，碩士研究生1300名，博士研究生300名。恢復高考后，培養出了中國科學院院士尚永豐、陳化蘭等一大批專家學者，并為甘肅省、市、縣、鄉提供了70%以上的獸醫管理與技術骨干。動物醫學專業獲得國家級“特色專業”、國家級“本科專業綜合改革試點”和國家級“卓越農林人才培養模式改革試點”，建有1門國家級精品資源共享課、1門國家級精品課程、6門省級精品課程，獲得1項國家級教學成果二等獎、2項甘肅省教學成果一等獎。學科團隊結合“高寒旱”地域特色和西部特有動物資源優勢，圍繞生態健康養殖、動物疫病防控、動物性食品安全與環境安全等，開展科技創新活動。2010年以來，主持國家“863”專項、國家科技支撐計劃、國家自然科學基金等項目近40項，省部級及橫向項目100余項，獲得甘肅省“科技技術獎”、甘肅省“科技進步獎”等獎項10余項，授權專利10余項，發表科研論文1000余篇，其中SCI論文200余篇，尤其在國際頂級學術刊物Science上發表論文2篇，主（副主）編教材、專著40余部。依托青藏高原特色動物高效生態繁育創新團隊，國家現代農業產業技術體系肉牛牦牛體系疾病防控研究室傳統中獸醫獸藥防治團隊、甘肅省草食畜產業技術體系牛羊疫病防控技術團隊、“三區”人才項目及“專家院”，大力推廣牦牛遺傳改良技術和動物疾病防治技術，每年培訓基層獸醫和農牧民1500余人次。